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单倍型Hi-C软件的开发与应用

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单倍型Hi-C软件的开发与应用
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-9页
缩略语表第9-10页
1 前言第10-21页
  1.1 三维基因组简介第10-14页
  1.2 单倍型三维基因组研究进展第14-18页
  1.3 研究内容与研究意义第18-21页
2 材料与方法第21-35页
  2.1 数据来源与预处理第21-22页
  2.2 HiCHap的整体工作流程第22-23页
  2.3 HiCHap的数据处理模块第23-28页
  2.4 HiCHap的矩阵构建及校正第28-32页
  2.5 HiCHap的染色质结构解析第32-35页
  2.6 单倍型ChIP-Seq数据处理第35页
3 结果与分析第35-49页
  3.1 单倍型染色质高阶结构第35-39页
  3.2 SNP校正对单倍型Hi-C的影响第39-42页
  3.3 测序深度对单倍型Hi-C的影响第42-44页
  3.4 等位特异性染色质环分析第44-49页
4 讨论与展望第49-51页
参考文献第51-57页
附录第57-60页
致谢第60页

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