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通城猪33天和65天胚胎骨骼肌的LongSAGE分析及3个基因全长cDNA的分离、定位和组织表达谱研究

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通城猪33天和65天胚胎骨骼肌的LongSAGE分析及3个基因全长cDNA的分离、定位和组织表达谱研究
论文目录
 
摘要第1-8 页
ABSTRACT第8-10 页
1 文献综述第10-21 页
  · 猪基因组研究现状第10-11 页
  · 利用LongSAGE技术进行转录谱(Transcriptome)分析第11-16 页
    · SAGE技术的发展第11-12 页
    · SAGE技术的一般原理和实验过程第12-13 页
      · SAGE的原理第12 页
      · SAGE的一般实验过程第12-13 页
    · 转录谱的研究方法第13-15 页
    · LongSAGE技术是研究转录谱与识别新基因的有效方法第15-16 页
  · 猪骨骼肌发生和发育的研究现状第16-19 页
    · 骨骼肌发生和发育的一般过程第16 页
    · 骨骼肌发生和发育的分子调控机制第16-17 页
    · 关于猪肌纤维的研究第17-18 页
    · 猪胚胎骨骼肌的研究现状第18-19 页
  · 猪33天和65天胚胎骨骼肌转录谱研究的必要性第19 页
  · 3个猪差异表达基因BIN1,TNNT2和TNNI2的研究现状第19-21 页
    · BIN1(Bridging integrator 1)基因第19-20 页
    · TNNT2(Troponin T2)基因和TNNI2(Troponin I2)基因第20-21 页
2 研究目的和意义第21-22 页
  · 目的第21 页
  · 意义第21-22 页
3 材料和方法第22-33 页
  · 材料第22-24 页
    · 构建LongSAGE标签库所需材料和试剂第22 页
    · 三个差异表达基因的研究材料第22 页
      · 组织样品第22 页
      · DNA样品第22 页
    · 主要试剂及配制第22-24 页
      · 主要试剂第22-23 页
      · 主要试剂的配制第23-24 页
      · 菌株第24 页
    · 主要仪器及分子生物学软件第24 页
  · 方法第24-33 页
    · 胚胎骨骼肌样品的采集第24 页
    · 总RNA的提取及完整性检测第24-25 页
    · RNA的反转录第25 页
    · LongSAGE标签库的构建第25-26 页
    · LongSAGE标签库的分析第26-27 页
      · LongSAGE标签的鉴定第26 页
      · T33和T65的转录谱分析第26-27 页
      · T33和T65高表达标签的GO(Gene Ontology)分析第27 页
      · 差异表达标签的统计分析第27 页
    · 三个差异表达基因全长cDNA的分离第27-29 页
      · 组织样品RNA的制备和反转录第27 页
      · 引物设计第27-28 页
      · PCR扩增条件第28 页
      · PCR产物的纯化、克隆和测序第28-29 页
    · 三个差异表达基因的组织表达谱分析第29-30 页
    · 两个差异表达基因的RH物理定位法第30-32 页
      · 引物设计第30 页
      · PCR扩增及其分型方法第30-32 页
    · 利用EST信息寻找SNP位点第32-33 页
4 结果第33-48 页
  · T33和T65 LongSAGE标签库的整体情况第33-34 页
  · T33和T65转录谱分析结果第34-36 页
  · T33和T65高表达标签的GO分析结果第36-37 页
  · 在T33和T65中差异表达的标签统计分析结果第37-38 页
  · 三个差异表达基因全长cDNA的分离结果第38-44 页
    · BIN1基因的cDNA序列分析第39-41 页
    · TNNI2基因的cDNA序列分析第41-43 页
    · TNNT2基因的cDNA序列分析第43-44 页
  · 三个差异表达基因组织表达谱分析结果第44-45 页
  · BIN1和TNNT2基因的RH物理定位结果第45 页
  · BIN1基因的SNP位点预测结果第45-48 页
5 讨论第48-53 页
  · 猪胚胎发育时期的选择第48 页
  · 通城猪胚胎骨骼肌33天和65天的转录谱特点第48-49 页
  · 关于利用LongSAGE方法研究猪胚胎骨骼肌转录谱第49-51 页
  · SAGE/LongSAGE数据库分析方法的探讨第51-52 页
  · 关于高通量方法筛选差异表达基因进行功能研究的思考第52-53 页
6 小结第53-55 页
  · 本研究获得的主要结果第53 页
  · 本研究的创新点与特色第53-54 页
  · 本研究的不足之处第54-55 页
参考文献第55-64 页
附录第64-71 页
  附录1 缩略词表(Abbreviations)第64-65 页
  附录2 附表1-3第65-68 页
  附录3 附图1-4第68-71 页
致谢第71-72 页

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