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须癣毛癣菌转录组测序分析及ZafA基因遗传转化用双元载体的构建

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须癣毛癣菌转录组测序分析及ZafA基因遗传转化用双元载体的构建
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-11页
第一章 文献综述第11-21页
  1.1 须癣毛癣菌的研究进展第11-15页
    1.1.1 须癣毛癣菌及其毒力作用第11-12页
    1.1.2 须癣毛癣菌的流行病学第12-13页
    1.1.3 锌元素对须癣毛癣菌的重要性第13-14页
    1.1.4 ZafA基因及其同系物研究概况第14-15页
  1.2 转录组测序研究进展第15-18页
    1.2.1 传统转录组测序技术第15-16页
    1.2.2 RNA测序技术第16页
    1.2.3 RNA-Seq数据分析第16-18页
  1.3 遗传转化用双元载体的研究进展第18-20页
    1.3.1 根癌农杆菌介导的真菌遗传转化第18页
    1.3.2 双元载体的研究现状第18-20页
  1.4 展望第20-21页
第二章 须癣毛癣菌转录组测序分析及ZafA基因的确定第21-43页
  2.1 材料第21-22页
    2.1.1 主要试剂、菌株及仪器第21-22页
    2.1.2 试剂配置第22页
  2.2 方法第22-28页
    2.2.1 须癣毛癣菌的培养第22-23页
    2.2.2 须癣毛癣菌总RNA的提取第23页
    2.2.3 cDNA文库构建及Illumina测序第23-24页
    2.2.4 数据分析及功能注释第24-25页
    2.2.5 确定与锌吸收转运相关的基因第25页
    2.2.6 qRT-PCR验证第25-26页
    2.2.7 须癣毛癣菌ZafA基因的克隆与测序第26-28页
  2.3 结果第28-39页
    2.3.1 锌缺乏对须癣毛癣菌生长的影响第28-29页
    2.3.2 测序质量及组装结果第29-30页
    2.3.4 基因的基本功能注释第30-34页
    2.3.5 差异表达分析第34-36页
    2.3.6 须癣毛癣菌与锌吸收转运相关的基因第36-38页
    2.3.7 qRT-PCR验证结果第38页
    2.3.8 须癣毛癣菌ZafA基因第38-39页
  2.4 讨论第39-43页
    2.4.1 须癣毛癣菌的转录组测序第39-40页
    2.4.2 锌缺乏对须癣毛癣菌生长及基因表达的影响第40-41页
    2.4.3 须癣毛癣菌中的锌吸收相关基因第41-43页
第三章 须癣毛癣菌ZafA基因转化用双元载体的构建第43-54页
  3.1 材料第43-45页
    3.1.1 主要菌株、质粒、试剂以及仪器第43-44页
    3.1.2 试剂配置第44-45页
  3.2 方法第45-49页
    3.2.1 质粒pAN7-1 的扩增第45页
    3.2.2 质粒pAN7-1 的提取第45页
    3.2.3 双元载体pDHt/SK的扩增与提取第45页
    3.2.4 双元载体pDHt/SK的双酶切第45-46页
    3.2.5 引物设计第46-47页
    3.2.6 高保真扩增须癣毛癣菌ZafA基因侧翼序列第47页
    3.2.7 DNA回收测序第47页
    3.2.8 高保真扩增hph基因第47页
    3.2.9 DNA回收测序第47-48页
    3.2.10 重组克隆第48页
    3.2.11 重组克隆产物的转化与鉴定第48-49页
  3.3 结果第49-52页
    3.3.1 ZafA基因侧翼片段及hph基因扩增结果第49-50页
    3.3.2 载体pDHt/ ZafAⅠ、Ⅱ::hph鉴定结果第50-52页
  3.4 讨论第52-54页
结论第54页
创新点第54-55页
参考文献第55-62页
附录第62-72页
致谢第72-73页
作者简介第73页

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