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生物过程的形式化建模及仿真

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生物过程的形式化建模及仿真
论文目录
 
摘要第1-6 页
Abstracts第6-10 页
第一章 概述第10-25 页
  · 研究背景及意义第10-12 页
  · 系统生物建模第12-18 页
    · 数学方法第14-16 页
    · 形式化方法第16-18 页
  · 进程代数和生物学第18-22 页
  · 研究现状及问题第22-24 页
  · 研究内容第24-25 页
第二章 基于随机π演算的形式化建模第25-41 页
  · π演算第25-27 页
  · 随机 Pi演算第27-28 页
  · 形式化描述第28-30 页
  · 建模实例第30-34 页
    · 聚合反应第30-32 页
    · 酶促反应第32-34 页
  · 模拟工具软件第34-35 页
    · BioSPi第34-35 页
    · Stochastic Pi Machine(SPIM)第35 页
  · 连续性模拟算法第35-36 页
  · 生物过程描述与仿真第36-41 页
    · 生物钟过程第36-38 页
    · 随机π演算模拟生物钟第38-41 页
第三章 基于膜计算的形式化建模第41-51 页
  · P Systems第42-45 页
  · 随机p系统第45-46 页
  · 建模生物过程第46-49 页
  · 仿真结果第49-50 页
  · 结论第50-51 页
第四章 总结第51-57 页
  · 主要工作第51 页
  · 不足之处第51-52 页
  · 待解决的问题第52-57 页
参考文献第57-60 页
附录 1: StochPsys核心代码第60-69 页
附录 2: SPiM核心代码第69-74 页
致谢第74-75 页
攻读硕士学位期间发表的论文第75 页

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