基于组合设计策略提高卤醇脱卤酶HheC降解2，3-DCP的活性 |
论文目录 | | | 摘要 | 第1-6页 | | abstract | 第6-8页 | | 20种常见氨基酸的中英文对照及缩写 | 第8-9页 | | 文中涉及的化合物的中英文名称对照及缩写 | 第9-12页 | | 第一章 绪论 | 第12-23页 | | 1.1 TCP和生物降解概述 | 第13-15页 | | 1.1.1 1,2,3-三氯丙烷的简介 | 第13页 | | 1.1.2 TCP的生物降解 | 第13-15页 | | 1.2 卤醇脱卤酶的概述 | 第15-20页 | | 1.2.1 卤醇脱卤酶HheC的结构 | 第15-16页 | | 1.2.2 卤醇脱卤酶HheC的催化机理及相关酶促动力学研究 | 第16-18页 | | 1.2.3 卤醇脱卤酶HheC的应用 | 第18-20页 | | 1.3 卤醇脱卤酶的改造研究 | 第20-22页 | | 1.4 本研究的目的和意义 | 第22-23页 | | 第二章 经典分子动力学模拟 | 第23-32页 | | 2.1 经典MD模拟步骤 | 第24-28页 | | 2.1.1 初始结构的准备 | 第24-25页 | | 2.1.2 经典MD模拟 | 第25-28页 | | 2.2 模拟结果的分析方法 | 第28页 | | 2.3 结果分析 | 第28-32页 | | 第三章 CASTING组合文库的构建 | 第32-48页 | | 3.1 实验材料 | 第32-33页 | | 3.1.1 材料 | 第32-33页 | | 3.1.2 实验仪器及设备 | 第33页 | | 3.1.3 试剂配制 | 第33页 | | 3.2 实验方法 | 第33-39页 | | 3.2.1 MD指导的饱和突变体文库构建 | 第33-35页 | | 3.2.2 改进的双突变位点PCR方法 | 第35-37页 | | 3.2.3 快速筛选突变文库 | 第37-38页 | | 3.2.4 良性突变体的活性测定 | 第38页 | | 3.2.5 良性突变体的动力学拆分 | 第38-39页 | | 3.3 结果与讨论 | 第39-45页 | | 3.3.1 脱卤活性提高的突变体 | 第39-40页 | | 3.3.2 突变文库突变位点的性质分析：文库A，B，C--底物结合口袋 | 第40-41页 | | 3.3.3 突变文库突变位点的性质分析：位于活性口袋入口处的文库D | 第41页 | | 3.3.4 突变文库突变位点的性质分析：位于卤离子结合位点的文库E | 第41页 | | 3.3.5 突变文库突变位点的性质分析：靠近催化中心的的文库F | 第41-42页 | | 3.3.6 CASTing文库立体选择性的变化趋势 | 第42-45页 | | 3.4 1,2,3-三氯丙烷(TCP)的生物降解 | 第45-46页 | | 3.5 本章总结 | 第46-48页 | | 第四章 组合文库的构建和筛选 | 第48-56页 | | 4.1 实验材料 | 第48页 | | 4.1.1 实验材料及仪器及设备 | 第48页 | | 4.1.2 试剂配制 | 第48页 | | 4.2 突变体文库构建 | 第48-49页 | | 4.3 突变体文库的筛选 | 第49-50页 | | 4.4 突变体的表达与检测 | 第50-51页 | | 4.5 突变体文库的结果分析 | 第51-53页 | | 4.6 分子模拟及对接结果分析 | 第53-56页 | | 第五章 总结与展望 | 第56-60页 | | 5.1 总结 | 第56-57页 | | 5.2 展望 | 第57-60页 | | 5.2.1 脱卤反应外消旋化的优化 | 第57-58页 | | 5.2.2 逆转卤醇脱卤酶HheC的立体选择性 | 第58页 | | 5.2.3 卤醇脱卤酶参与的酶级联反应 | 第58-60页 | | 致谢 | 第60-61页 | | 参考文献 | 第61-66页 | | 攻硕期间的研究成果 | 第66-67页 |
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