大规模蛋白质相互作用网络复合物挖掘算法研究



大规模蛋白质相互作用网络复合物挖掘算法研究

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大规模蛋白质相互作用网络复合物挖掘算法研究

论文目录
摘要	第1-5页
ABSTRACT	第5-9页
第一章绪论	第9-15页
· 蛋白质相互作用网络	第9-11页
· 课题研究的意义	第11-12页
· 本文的主要研究内容	第12-13页
· 论文的结构	第13-15页
第二章蛋白质复合物挖掘相关研究	第15-26页
· 传统的蛋白质复合物挖掘研究	第16-19页
· 基于图划分的方法	第16页
· 基于层次聚类的方法	第16-17页
· 基于密度的局部搜索方法	第17-18页
· 其他方法	第18-19页
· 融合多元数据的蛋白质复合物挖掘研究	第19-21页
· 融合基因表达数据的蛋白质复合物挖掘	第19-20页
· 融合其他多元信息的蛋白质复合物挖掘	第20-21页
· 基于蛋白质复合物挖掘的扩展研究	第21-23页
· 蛋白质复合物挖掘研究的新技术	第23-24页
· 本章小结	第24-26页
第三章基于团渗透和距离限制的蛋白质复合物识别算法	第26-45页
· CPM算法分析	第26-28页
· 基于团渗透和距离限制的蛋白质复合物识别参数算法CPM-DR	第28-30页
· CPM-DR模型	第28-29页
· 算法CPM-DR	第29-30页
· 基于团渗透和距离限制的蛋白质复合物识别非参数算法CP-DR	第30-34页
· CP-DR模型	第30-32页
· 算法CP-DR	第32-34页
· 实验结果与分析	第34-43页
· 与MIPS数据库中的已知蛋白质复合物比较	第34-38页
· 算法的特异性、敏感度和综合评价	第38-40页
· 功能富集性分析	第40-41页
· 重叠率分析	第41-43页
· 本章小结	第43-45页
第四章基于关键蛋白质和局部适应的蛋白质复合物识别算法	第45-65页
· 基于关键蛋白质和局部适应的蛋白质复合物模型	第46-48页
· 种子结点选择	第48页
· 算法EPOF	第48-50页
· 实验结果与分析	第50-63页
· 与已知蛋白质复合物比较	第51-52页
· 算法敏感度和特异性	第52-53页
· 功能富集性分析	第53-54页
· 算法精度分析	第54-56页
· 蛋白质复合物密度分析	第56-59页
· 交叠率分析	第59-60页
· 种子有效性验证	第60-62页
· 加权蛋白质网络实验结果比较分析	第62-63页
· 本章小结	第63-65页
第五章基于组织特异性和局部适应的蛋白质复合物识别算法	第65-79页
· 组织特异性子网构建	第66-67页
· 基于组织特异性和局部适应的蛋白质复合物模型	第67-69页
· 算法TSOF	第69-71页
· 实验结果与分析	第71-77页
· 实验数据	第71-72页
· 功能富集性分析	第72-75页
· 算法精度分析	第75页
· 种子有效性验证	第75-77页
· 本章小结	第77-79页
第六章总结	第79-84页
· 研究贡献与创新点	第79-81页
· 研究展望	第81-84页
参考文献	第84-96页
致谢	第96-98页
攻读硕士学位期间主要研究成果	第98-99 页

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