线粒体呼吸链复合物Ⅱ与商品化杀菌剂结合模式研究



线粒体呼吸链复合物Ⅱ与商品化杀菌剂结合模式研究

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线粒体呼吸链复合物Ⅱ与商品化杀菌剂结合模式研究

论文目录
摘要	第1-7页
Abstract	第7-10页
第一章绪论	第10-26页
1.1 膜蛋白的结构和分类	第10页
1.2 线粒体呼吸链复合物Ⅱ的研究概况	第10-22页
1.2.1 线粒体及线粒体呼吸链	第10-11页
1.2.2 线粒体呼吸链复合物Ⅱ的组成及生物学功能	第11-15页
1.2.3 线粒体呼吸链复合物Ⅱ的结构生物学研究	第15-19页
1.2.4 线粒体呼吸链复合物Ⅱ类杀菌剂的研究进展	第19-22页
1.3 理论研究方法	第22-25页
1.3.1 量子化学方法	第22页
1.3.2 分子对接方法	第22-23页
1.3.3 分子动力学方法	第23-24页
1.3.4 结合自由能计算	第24-25页
1.4 课题的提出和本文研究的内容	第25-26页
第二章线粒体呼吸链复合物Ⅱ和抑制剂分子对接研究	第26-32页
2.1 前言	第26-27页
2.2 分子对接	第27-30页
2.3 MM/PBSA结合自由能的计算	第30-31页
2.4 本章小结	第31-32页
第三章线粒体呼吸链复合物Ⅱ和抑制剂的膜动力学研究	第32-45页
3.1 前言	第32-33页
3.2 实验过程及计算方法	第33-35页
3.2.1 抑制剂小分子的预处理及其参数的计算	第33页
3.2.2 [Fe-S]cluster参数的计算	第33-34页
3.2.3 分子对接方法	第34-35页
3.3 联合原子力场中DPPC膜的优化	第35-36页
3.4 动力学模拟中参数的介绍	第36-38页
3.4.1 蛋白力场	第36页
3.4.2 水分子力场	第36页
3.4.3 简单点电荷力场	第36页
3.4.4 脂分子力场	第36-37页
3.4.5 分子动力学模拟中的系综	第37页
3.4.6 分子动力学-DPPC膜的优化	第37页
3.4.7 实验结果分析-DPPC膜的优化	第37-38页
3.5 分子动力学方法	第38-43页
3.5.1 分子动力学模拟	第39页
3.5.2 萎秀灵(Carboxin)动力学结果分析	第39-41页
3.5.3 噻呋酰胺(Thifluzamide)-动力学结果分析	第41-43页
3.6 MM/PBSA结合自由能计算	第43-44页
3.7 本章小节	第44-45页
全文总结	第45-46页
参考文献	第46-50页
致谢	第50页

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