我国志贺菌的流行分布与基因组进化



我国志贺菌的流行分布与基因组进化

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我国志贺菌的流行分布与基因组进化

论文目录
中文摘要	第1-5页
ABSTRACT	第5-6页
· 系统回顾及Meta分析：中国大陆地区近十年流行的志贺菌血清群和血清型分布状况	第6-38页
· 前言	第6-10页
· 材料与方法	第10-14页
· 文献检索	第10页
· 文献的纳入、排除标准	第10页
· 数据提取	第10-11页
· 国家和地区的经济数据	第11-12页
· 统计分析	第12-14页
· 结果	第14-34页
· 检索结果	第14-17页
· 数据统计	第17-34页
· 讨论	第34-38页
· 福氏志贺菌基因组进化研究	第38-64页
· 前言	第38-40页
· 材料与方法	第40-48页
· 样品收集及高通量测序	第40页
· 测序数据质量控制	第40-41页
· 以福氏2a型301株志贺菌为参考株做比对,找出全基因组SNPs	第41-43页
· 确定外围群基因组并作比对	第43-45页
· 用贝叶斯法分析进化关系及分歧时间	第45-48页
· 结果与讨论	第48-64页
· 样本收集	第48-49页
· 高通量测序及质量控制	第49-51页
· 基因组比对及SNP分析	第51-53页
· 大肠杆菌及志贺菌进化分析	第53-56页
· 贝叶斯进化分析	第56-64页
参考文献	第64-68页
发表文章	第68-70页
致谢	第70-72 页

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