宏基因组读段组装融合与基因标注算法研究



宏基因组读段组装融合与基因标注算法研究

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宏基因组读段组装融合与基因标注算法研究

论文目录
摘要	第1-6页
Abstract	第6-11页
第一章绪论	第11-18页
1.1 生物信息学概论及现状	第11-12页
1.2 宏基因组学简介	第12-15页
1.3 本文研究意义	第15-16页
1.4 本文构成	第16-18页
第二章宏基因组分析和基因片段组装	第18-26页
2.1 宏基因组分析流程介绍	第18-23页
2.1.1 环境样品采样和文库构建	第18-20页
2.1.2 读段组装	第20-21页
2.1.3 基因识别	第21-22页
2.1.4 物种多样性分析	第22-23页
2.1.5 功能性注释	第23页
2.2 基因片段组装国内外现状	第23-25页
2.3 本章小结	第25-26页
第三章宏基因组读段组装融合与网络比对算法	第26-42页
3.1 GTCC算法	第26-27页
3.2 模拟读段的生成及组装软件的调用	第27-28页
3.3 重叠群的融合	第28-32页
3.4 基因序列初步识别	第32页
3.5 网络比对	第32-36页
3.5.1 Smith-Waterman算法简介	第32-33页
3.5.2 网络比对算法	第33-36页
3.6 实验结果分析	第36-40页
3.6.1 实验环境	第36页
3.6.2 实验数据	第36-37页
3.6.3 实验结果评估指标	第37-38页
3.6.4 实验结果分析	第38-40页
3.7 本章小结	第40-42页
第四章基因序列可视化测试平台	第42-52页
4.1 平台介绍	第42-44页
4.1.1 平台设计背景	第42页
4.1.2 平台总体设计	第42-43页
4.1.3 平台开发环境	第43-44页
4.2 平台相关模块介绍	第44-46页
4.2.1 输入模块	第44-45页
4.2.2 评测模块	第45-46页
4.2.3 结果呈现模块	第46页
4.3 平台展示	第46-51页
4.3.1 平台入.展示	第46-47页
4.3.2 基因片段组装部分展示	第47-48页
4.3.3 基因预测部分展示	第48-51页
4.4 本章小结	第51-52页
第五章总结和展望	第52-54页
5.1 总结	第52-53页
5.2 展望	第53-54页
参考文献	第54-59页
致谢	第59-60页
攻读硕士学位期间参与的科研项目	第60页

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