利用高通量测序技术探索毛竹冬笋成笋机制



利用高通量测序技术探索毛竹冬笋成笋机制

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利用高通量测序技术探索毛竹冬笋成笋机制

论文目录
摘要	第1-7页
ABSTRACT	第7-11页
第一章绪论	第11-21页
引言	第11-21页
· 研究背景	第11-12页
· 研究意义和目的	第12页
· 毛竹生态学及形态学研究现状	第12-13页
· 毛竹地下部分生长及分布规律	第13-14页
· 毛竹基因组序列研究现状	第14-15页
· 测序技术的产生、现状及前景	第15-19页
· 转录组学的发展及RNA-seq技术的应用	第19-20页
· 本课题研究内容	第20-21页
第二章毛竹基因组测序文库制备	第21-35页
· 取样地概况	第21页
· 实验材料	第21-22页
· 实验步骤	第22-35页
· 毛竹总RNA提取	第22-25页
· RNA质量分析	第25-26页
· 总RNA纯化	第26-27页
· RNA-seq文库构建	第27-31页
· 转录组测序流程	第31-35页
· 原始数据过滤	第32页
· 转录组数据的分析	第32页
· BLAST比对	第32-33页
· ALL-Unigene功能注释及COG分类	第33页
· Unigene差异表达基因分析	第33-34页
· 差异表达基因代谢通路分析	第34-35页
第三章实验数据结果及分析	第35-63页
· 转录组原始数据整理	第35-37页
· 毛竹与拟南芥同源基因整理	第37页
· 毛竹笋芽、鞭梢芽、鞭芽表达基因的拟南芥同源基因功能注释	第37-48页
· 鞭梢芽与鞭芽基因的差异表达基因功能注释	第39-42页
· 笋芽与鞭芽基因的差异表达基因功能注释	第42-45页
· 鞭梢芽与笋芽基因的差异表达基因功能注释	第45-48页
· 不同组织差异基因表达分析	第48-63页
· 毛竹鞭梢芽与笋芽、鞭芽差异基因的比对	第48-63页
第四章结论与展望	第63-67页
· 结论	第63-65页
· COG_ONTOLOGY分析总结	第63页
· GOTERM_BP_FAT功能注释分析总结	第63-64页
· KEGG_PATHWAY分析总结	第64页
· PIR_SUPERFAMILY分析总结	第64-65页
· 讨论	第65页
· 创新性	第65-66页
· 不足与展望	第66-67页
· 不足	第66页
· 展望	第66-67页
参考文献	第67-70页
致谢	第70页

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