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虾夷扇贝（Patinopecten yessoensis）类胡萝卜素积累相关基因和SNP位点筛查
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虾夷扇贝（Patinopecten yessoensis）类胡萝卜素积累相关基因和SNP位点筛查
论文目录
 
摘要第1-7页
Abstract第7-14页
第一章 文献综述第14-27页
　　0 引言第14页
　　1 类胡萝卜素结构、分布与功能第14-19页
　　　　· 类胡萝卜素结构第15-16页
　　　　· 类胡萝卜素的分布第16-17页
　　　　· 海洋生物中的类胡萝卜素第17页
　　　　· 类胡萝卜素功能第17-19页
　　2 类胡萝卜素代谢及酶学研究第19-22页
　　　　· 类胡萝卜素代谢通路第19-20页
　　　　· 影响类胡萝卜素吸收效率的因素第20-22页
　　3 疾病/性状相关候选基因筛查方法第22-27页
　　　　· 候选基因法第22-23页
　　　　· 遗传连锁分析第23页
　　　　· 基因共表达网络分析第23-24页
　　　　· 遗传连锁与表达的结合第24-25页
　　　　· 表观遗传学方法第25页
　　　　· 全基因组关联分析第25-27页
第二章 虾夷扇贝 SCD 基因克隆及其在海大金贝和普通扇贝中的表达差异分析第27-48页
　　0 引言第27-28页
　　1 实验材料第28-30页
　　　　· 材料第28页
　　　　· 试剂第28-30页
　　2 实验方法第30-38页
　　　　· 虾夷扇贝总 RNA 的提取第30-31页
　　　　· 反转录合成一链 cDNA第31-32页
　　　　· 虾夷扇贝转录组数据库中获得目的基因片段第32页
　　　　· 目的基因片段的 PCR 扩增第32-34页
　　　　· 基因全长 cDNA 序列的获得第34-36页
　　　　· 序列及系统进化分析第36-37页
　　　　· 基因表达分析第37-38页
　　3 结果第38-46页
　　　　· 虾夷扇贝 SCD 序列结构第38-39页
　　　　· 虾夷扇贝 SCD 基因进化分析第39-43页
　　　　· 虾夷扇贝 SCD 蛋白分析第43页
　　　　· SCD 启动子的 in silico 分析第43-44页
　　　　· SCD 表达分析第44-46页
　　4 讨论第46-48页
　　　　· 虾夷扇贝 SCD 结构特征第46页
　　　　· 虾夷扇贝 SCD 表达模式第46-47页
　　　　· 海大金贝与普通虾夷扇贝 SCD 基因表达差异分析第47-48页
第三章 虾夷扇贝胡萝卜素积累的全基因组关联分析（GWAS）第48-67页
　　0 引言第48页
　　1 实验材料第48-51页
　　　　· 扇贝材料第48-49页
　　　　· 试剂第49-51页
　　2 实验方法第51-59页
　　　　· DNA 的提取第51-52页
　　　　· SOLiD 测序文库构建第52-55页
　　　　· 虾夷扇贝类胡萝卜素积累相关 SNP 的筛选第55-56页
　　　　· 类胡萝卜素积累相关 SNP 的验证第56-58页
　　　　· SNP 位点的基因组定位及序列的功能注释与分析第58-59页
　　3 结果与分析第59-64页
　　　　· 测序结果分析第59页
　　　　· 标签序列的聚类和 SNP 位点筛选第59-60页
　　　　· 群体验证结果第60-63页
　　　　· SNP 位点的基因组定位及功能注释第63-64页
　　4 讨论第64-67页
　　　　· 虾夷扇贝类胡萝卜素积累相关 SNP 位点第64-65页
　　　　· 海大金贝类胡萝卜素积累相关候选基因第65-67页
参考文献第67-73页
附录第73-81页
致谢第81-82页
个人简历第82页
学术成果第82-83 页

本篇论文共83页，点击这进入下载页面。
 
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