洋葱鳞茎类黄酮类化合物含量及其转录组分析



洋葱鳞茎类黄酮类化合物含量及其转录组分析

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洋葱鳞茎类黄酮类化合物含量及其转录组分析

论文目录
摘要	第1-9页
ABSTRACT	第9-11页
缩略词表	第11-12页
前言	第12-13页
第一章文献综述	第13-25页
1 洋葱简介	第13-14页
1.1 洋葱的起源	第13页
1.2 洋葱的分类	第13页
1.3 洋葱的食用价值	第13-14页
2 花青素及黄酮研究进展	第14-16页
2.1 花青素简介	第14页
2.2 花青素的定量、定性方法	第14-15页
2.3 黄酮简介	第15页
2.4 黄酮的定量、定性方法	第15页
2.5 抗氧化活性研究	第15-16页
3 植物材料RNA提取方法研究进展	第16-18页
3.1 多酚类物质	第16-17页
3.2 多糖类物质	第17页
3.3 葱属植物RNA提取	第17-18页
4 转录组测序研究进展	第18-21页
4.1 转录组及RNA-Seq概述	第18-19页
4.2 RNA-Seq在园艺上的应用	第19-20页
4.2.1 获得序列和注释转录本	第19页
4.2.2 分子标记开发和应用	第19-20页
4.2.3 功能基因的挖掘和基因差异表达分析	第20页
4.3 洋葱转录组研究进展	第20-21页
5 植物类黄酮生物合成及调控研究进展	第21-22页
5.1 类黄酮合成途径相关结构基因及其酶研究	第21-22页
5.1.1 查尔酮合成酶	第21-22页
5.1.2 查尔酮异构酶	第22页
5.1.3 黄酮醇合成酶	第22页
5.1.4 二氢黄酮醇还原酶	第22页
6 本研究目的和意义	第22-25页
第二章三种不同颜色洋葱黄酮和花青素含量、组份及抗氧化活性研究	第25-37页
1 材料与方法	第27-29页
1.1 试验材料与化学试剂	第27页
1.2 洋葱花青素及黄酮提取	第27页
1.3 HPLC-DAD和HPLC-ESI-MS分析	第27-28页
1.4 花青素含量测定	第28页
1.5 黄酮含量测定	第28页
1.6 总酚含量测定	第28页
1.7 抗氧化活性测定	第28-29页
1.7.1 DPPH值测定	第28-29页
1.7.2 ABTS值测定	第29页
1.7.3 总抗氧化能力的测定	第29页
1.8 数据分析	第29页
2 结果分析与讨论	第29-35页
2.1 花青素和黄酮含量	第29-30页
2.2 HPLC-DAD和HPLC-ESI-MS分析洋葱中花青素和黄酮组成分析	第30-33页
2.3 总酚含量和抗氧化活性研究	第33-34页
2.4 相关性分析	第34-35页
3 小结	第35-37页
第三章洋葱不同组织RNA提取方法比较分析	第37-45页
1 材料与方法	第38-40页
1.1 试验材料	第38-39页
1.2 RNA提取方法	第39-40页
1.2.1 TaKaRa试剂盒	第39页
1.2.2 Tiangene试剂盒	第39页
1.2.3 Trizol法	第39页
1.2.4 pBIOZOL法	第39-40页
1.3 总RNA的完整性及质量检测	第40页
1.4 RT-PCR检测	第40页
2 结果与分析	第40-42页
2.1 不同方法提取的洋葱RNA的凝胶电泳分析	第40-41页
2.2 不同方法提取洋葱RNA质量浓度和纯度的检测	第41-42页
2.3 RT-PCR检测mRNA的质量	第42页
3 讨论与结论	第42-45页
第四章三种不同颜色洋葱转录组分析	第45-61页
1 材料与方法	第46-48页
1.1 供试材料	第46页
1.2 试验方法	第46-48页
1.2.1 总RNA的提取	第46页
1.2.2 数据过滤及组装	第46-47页
1.2.3 Unigene功能注释和分类	第47页
1.2.4 基因表达量计算及差异表达基因筛选	第47页
1.2.5 差异基因功能注释	第47-48页
1.2.6 Unigene SSR及SNP分析	第48页
2 结果与分析	第48-57页
2.1 Illumina测序和从头组装	第48-49页
2.2 Unigene功能注释	第49-52页
2.2.1 COG功能注释	第49-51页
2.2.2 NR分类注释	第51-52页
2.2.3 GO功能注释分析	第52页
2.3 Unigene表达差异分析	第52-54页
2.3.1 差异表达基因	第52-53页
2.3.2 差异表达基因GO功能分析	第53页
2.3.3 KEGG pathway富集分析	第53-54页
2.4 类黄酮生物合成途径差异表达基因筛选	第54-56页
2.5 Unigene SSR分析	第56-57页
2.6 Unigene SNP分析	第57页
3 讨论	第57-61页
全文结论	第61-63页
参考文献	第63-71页
论文发表情况	第71-73页
致谢	第73页

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